Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDH1P12830 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDH1P12830 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDH1P12830 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms