Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms