Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEFHP12036 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEFHP12036 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NEFHP12036 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms