Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODC1P11926 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODC1P11926 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ODC1P11926 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODC1P11926 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms