Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PGA3P0DJD8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms