Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACAA1P09110 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACAA1P09110 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms