Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKCGP05129 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCGP05129 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms