Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TK1P04183 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TK1P04183 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TK1P04183 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms