Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG12O94817 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATG12O94817 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms