Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIAO1O76071 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIAO1O76071 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms