Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F6O75461 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms