Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP2O75323 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms