Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms