Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPAA1O43292 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPAA1O43292 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms