Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms