Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBTB39O15060 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms