Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H7C1D1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H7C1D1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H7C1D1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
H7C1D1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
H7C1D1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms