Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CLDN25C9JDP6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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