Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms