Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVV-1B6SEH8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms