Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF879B4DU55 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms