Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms