Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms