Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT87PA6NCN2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT87PA6NCN2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT87PA6NCN2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT87PA6NCN2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT87PA6NCN2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms