Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM221AA4D161 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms