Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
SSPOA2VEC9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms