Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms