Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms