Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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