Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB15Q9Y5E8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB15Q9Y5E8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms