Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms