Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THSD7AQ9UPZ6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
THSD7AQ9UPZ6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms