Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms