Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJD2Q9UKL4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms