Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACL1Q9UJ83 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACL1Q9UJ83 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms