Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPC1L1Q9UHC9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms