Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms