Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRPC4Q9UBN4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRPC4Q9UBN4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms