Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPG2Q9UBF2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms