Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NLKQ9UBE8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NLKQ9UBE8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NLKQ9UBE8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NLKQ9UBE8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NLKQ9UBE8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms