Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHPF2Q9P2E5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms