Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USP36Q9P275 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP36Q9P275 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms