Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD5Q9P267 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms