Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
VNN3Q9NY84 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VNN3Q9NY84 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms