Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms