Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLN6Q9NWW5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms