Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM248Q9NWD8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM248Q9NWD8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms