Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4L1Q9NU39 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L1Q9NU39 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms