Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNPLA3Q9NST1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms