Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DUOX2Q9NRD8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DUOX2Q9NRD8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms